El IBA funciona desde sus inicios como centro de formación teológica de la iglesia Hermanos Menonitas del Paraguay. Es patrocinado por la Asociación Hermanos Menonitas y la Convención Evangélica de Iglesias Paraguayas de Hermanos Menonitas. El Consejo Directivo está conformado por tres representantes de cada conferencia, más el Administrador y el Director General.
Asociación Hermanos Menonitas (Vereinigung der Mennoniten Brüdergemeinden Paraguay)
Convención Evangélica de Iglesias Paraguayas Hermanos Menonitas